Od 1994 r. Instytut prowadzi Studia Doktoranckie w zakresie chowu i hodowli zwierząt, genetyki molekularnej, biotechnologii zwierząt, embriologii doświadczalnej, zachowania się zwierząt, zróżnicowanych systemów produkcji zwierzęcej i jakości surowców pochodzenia zwierzęcego oraz bioróżnorodności.
Od czasu powołania Studiów 52 osoby uzyskało stopień doktora nauk rolniczych. W 2016 r. na Studiach Doktoranckich naukę kontynuowało 24 osoby.
Doktoranci biorą czynny udział w życiu naukowym Instytutu prowadząc badania, wygłaszając referaty naukowe i prezentując swoje doniesienia na krajowych i międzynarodowych konferencjach naukowych. Instytut oferuje również doktorantom pobyty naukowe we współpracujących laboratoriach zagranicznych oraz uczestnictwo w specjalistycznych kursach krajowych i zagranicznych.
Nabór kandydatów na Studia odbywa się okresowo i jest poprzedzony ogłoszeniami w prasie oraz na stronie internetowej Instytutu (www.ighz.edu.pl).
Podstawą kwalifikacji kandydatów jest ich dorobek naukowy i umiejętności przedstawione w życiorysie oraz wynik egzaminu przeprowadzonego przez powołaną w tym celu komisję. Podczas egzaminu sprawdzana jest między innymi znajomość języka angielskiego. Uczestnikami Studiów mogą być także obcokrajowcy.
Instytut oferuje zakwaterowanie na okres trwania studiów. W trakcie studiów doktoranci zobowiązani są do zrealizowania programu obowiązkowych zajęć, wykładów i złożenia stosownych egzaminów oraz do ukończenia lektoratu z języka angielskiego.
Wszystkie osoby zainteresowane rozpoczęciem kariery naukowej w Instytucie mogą zwracać się o dalsze informacje do Kierownika Studiów.